ДНК АНАЛИЗ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ОБРАЗЦОВ КОЗЛЫНЫХ ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ И СОХРАНЕНИЯ В УЗБЕКИСТАНЕ
Keywords:
C.falconeri и C.hircus, Capra sibirica,Abstract
Мы использовали видоспецифичные праймеры 16S РНК для амплификации полимеразной цепной реакции (ПЦР) для идентификации вида. Результаты молекулярного анализа с геном 16S позволяли идентифицировать Capra sibirica, C.falconeri и C.hircus принадлежащие к подсемейству Caprinae с помощью неинвазивный метод генетический отбор проб. Данный способ довольно прост в использовании, при этом позволяет избежать прямого контакта с животным, что минимизирует как степень воздействия на изучаемый объект и не требует существенных материальных и трудовых затрат исследователей. The protocol developed could be a valuable tool in the management and conservation of the Capra species occurring on the Uzbekistan.
References
Красная Книга Узбекистана. Ташкент, 2019. 2-том. С. 323-352.
Castelló J.R., Huffman B., Groves C. Bovids of the World: Antelopes, Gazelles, Cattle, Goats, Sheep, and Relatives. Princeton University Press, 2016. P. 113-114.
Geptner V.G., Naumov N.P. Mammals of the Soviet Union. Moscow: Vysshaya Shkola, 1961, 1. P.141.
Caragiulo A, Isabela Dias-Freedman I, Clark J. A, Rabinowitz S, Amato G. Mitochondrial DNA sequence variation and phylogeography of Neotropic pumas (Puma concolor) // Mitochondrial DNA, 2013. DOI:10.3109/19401736.2013.800486
Haltenorth T. Klassifikation der Saugetiere: Artiodactyla. Handbuch der Zoologie, 1963, vol. 8, no. 32(18). Р. 1-167.
Hammer Sabine E., Schwammer H.M., Suchentrunk F. Evidence for Introgressive Hybridization of Captive Markhor (Capra falconeri) with Domestic Goat: Cautions for Reintroduction. Biochem Genet, 2008. Vol: 46(3-4). P. 216-226.
Heptner V.G., Nasimovitch A.A., Bannikov A.A. Mammals of the Soviet Union: Artiodactyla and Perissodactyla. Smithsonian Institution Press, Washington, D.C., 1988. 1. P. 1-1147.
Pidancier N., Jordan S, Luikart G et al. Evolutionary his-tory of the genus Capra (Mammalia, Artiodactyla): discordance between mitochondrial DNA and Y-chromosome phylogenies. Molecular Phylogenetics and Evolution, 2006; 40(3). P. 739-749.
Reading R., Michel S., Suryawanshi K., Bhatnagar Y.V. Capra sibirica. The IUCN Red List of Threatened Species, 2020. P. 122.
Sokolov V.I. Fauna of USSR. Mammals: Ungulate (Orders Perissodactyla and Artiodactyla), Moscow: Akad. Nauk SSSR, 1959, 1(3). P. 79-81.
Weinberg P.I., Valdez R., Fedosenko A.K. Status of the Heptner´s Markhor (Capra falconeri heptneri) in Turkmenistan. J Mammal, 1997, 78. P. 826-829.
Kuchboev A.E., Krucken J., Ruziev B.H., Von Samson-Himmelstjerna G. Molecular phylogeny and diagnosis of species of the family Protostrongylidae from caprine hosts in Uzbekistan// Parasitology Research. 2015, Volume: 114 (4): - P. 1355-1364.
Raes J., Van de Peer Y. ForCon: a software tool for the conversion of sequence alignments // Embnet. News. 1999. Vol.6. P.10–12.
Hall, T.A. (1999). BioEdit: A User-Friendly Biological Sequence Alignment Editor and Analysis Program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symposium Series, 41, 95-98
Thompson, J.D., Higgins, D.G., Gibson, T.J. (1994). CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice. Nucleic acids research, 11, 22 (22), 4673-80. https://doi.org/10.1093/nar/22.22.4673.
Stecher, G., K. Tamura, S., Kumar. Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) for macos. Molecular Biology and Evolution, 2020, 37:1237 - 1239. P. doi.org/10.1093/molbev/msz312.
Nicholas K., Nicholas H. 1997. Gene Doc: А tool for editing and annotating multiple sequence alignments. http://wwwpscedu/biomed/genedoc